按手術(shù)方式劃分：

開放吻合器：主要用于傳統(tǒng)的開腹手術(shù)，如腹部外科、胸外科和小兒外科手術(shù)等。

腔鏡吻合器：用于微創(chuàng)手術(shù)，如腹腔鏡膽囊切除、結(jié)直腸癌切除等。

按結(jié)構(gòu)和功能劃分：

線性吻合器：用于組織的線性縫合，常用于腹部外科和胸外科。

環(huán)形吻合器（圓形吻合器） ：用于肛腸手術(shù)和消化道重建。

線性切割吻合器：同時具有切割和縫合功能，適用于需要快速離斷和閉合的手術(shù)。

荷包吻合器：用于制作荷包縫合，常用于肛腸手術(shù)。

皮膚吻合器：用于皮膚和筋膜的縫合。

管型吻合器：用于消化道重建手術(shù)中的端端、端側(cè)和側(cè)側(cè)吻合。

按使用場景劃分：

腔鏡專用吻合器：主要用于微創(chuàng)手術(shù)，如心胸外科、胃腸外科等。

開放吻合器：適用于傳統(tǒng)開腹手術(shù)。